禁忌指应在用药时应该避免的事情，或者不应该使用的药物。主要包括配伍禁忌，证候禁忌，妊娠用药禁忌，服药的饮食禁忌。
1，配伍禁忌
在中药配伍一节中，我们提到相恶、相反，相恶指两药配伍会减轻疗效，相反指两药配伍产生很强的毒副作用。所以相恶，相反是应该避免的情况。古人总结了十八反、十九畏歌，方便大家记忆。
十八反歌，说的是相反的情况，这些药配合使用后会产很强的毒副作用。内容如下：
本草明言十八反，半蒌贝蔹及攻乌；
藻戟遂芫俱战草，诸参辛芍叛藜芦。
半（半夏）蒌（瓜蒌）贝（贝母）蔹（白蔹）芨（白芨）与乌头（包括川乌、草乌、附子）相反
藻（海藻）戟（大戟 ）遂（甘遂）芫（芫花）与草（甘草）相反
诸参（人参、丹参、沙参、玄参等所有的参）辛（细辛）芍（赤芍、白芍）与藜芦相反
十九畏歌，说的是相恶的情况，这些药配合使用会减轻药效。内容如下：
硫黄原是火中精，朴硝一见便相争。
水银莫与砒霜见，狼毒最怕密陀僧。
巴豆性烈最为上，偏与牵牛不顺情。
丁香莫与郁金见，牙硝难合京三棱。
川乌草乌不顺犀，人参最怕五灵脂。
官桂善能调冷气，若逢石脂便相欺。
大凡修合看顺逆，炮爁(làn)炙煿(bó)莫相依。
2，证候禁忌
对于某一种病证，应该避免（不适合）使用的药物，使用后会加重病情，或不易康复，损害患者健康，这就是证候禁忌。
如体虚多汗者，忌用发汗药，以免出汗多而伤阴;阳虚里寒者，忌用寒凉药，以免伤阳更生里寒；阴虚内热者，慎用苦寒清热药，以免苦燥更伤阴；脾胃虚寒、大便稀溏者，忌用苦寒或泻下药，以免伤及脾胃；阴虚津亏者，忌用淡渗利湿药，以免加重津液的耗伤。
里热证，就忌用温里药。里寒证，则忌用寒凉清热的药。；妇女月经过多及崩漏者，忌用破血逐瘀之品，以免加重出血；脱证神昏者，忌用香窜的开窍药，以免耗气伤正；邪实而正不虚者，忌用补虚药，以免闭门留邪等等。
3，妊娠用药禁忌
有些药物会影响胎儿的生长发育和健康，甚至会引起堕胎，这些药物应该禁止使用或慎用。
从药性来讲主要包括忌活血破气、滑利攻下、芳香渗透、大热有毒之品。
1)）活血破气药:：可使血液循环加速，"迫血随气行",气乱则无力固胎，有堕胎风险。
2）滑利攻下类：有伤阴耗气之弊。阴伤则胎失所养，气耗则胎失固摄，胎儿易下坠。
3）大辛大热类：辛热而燥，辛热走窜迫血妄行，燥能伤津，对胎儿不利，且多有不同程度的毒性，有堕胎之弊。
4）芳香渗透类：多辛温香躁，有疏通气机的作用。气行则血行，以致迫胎外出。
5）有毒药物：有直接伤胎、腐胎的作用，当严禁使用。
古人总结了《妊娠禁忌歌》，虽然不是全总，却是重要的参考：
蚖(昆虫的通称)斑(斑蝥)水蛭及虻虫，乌头附子配天雄；
野葛水银并巴豆，牛膝薏苡与蜈蚣；
三棱芫花代赭麝，大戟蝉蜕黄雌雄(雌黄、雄黄)；
牙硝 芒硝牡丹桂，槐花牵牛皂角同；
半夏南星与通草，瞿麦干姜桃仁通(木通)；
硇砂 干漆 蟹爪甲，地胆茅根都失中 。
4，服药的饮食禁忌
在服药期间不能或不易食用的食物，称为服药时的禁忌，俗称忌口。
一般而言，在病人服药期间，均应忌食生冷、辛热、油腻、腥膻、有刺激性的食物。再者，根据患者病情的不同，饮食禁忌也有区别。如热性病应忌食辛辣、油腻、煎炸等助热伤阴的食物；寒 证、 阴 证 应 忌食 生冷 等 寒 凉 伤 阳 的 食物；肝阳上亢，头晕目眩、烦躁易怒等应忌食胡椒、辣椒、大蒜、白酒等辛热助阳升浮之品；脾胃虚弱者应忌食油炸粘腻、不易消化的食物；疮疡、皮肤病患者，应忌食鱼、虾、蟹等腥膻及辛辣刺激性食品。
另外，根据古籍记载，常山忌葱；地黄、何首乌忌葱、蒜、萝卜；薄荷忌鳖肉；茯苓忌 醋；鳖甲忌苋菜；蜜反生葱 柿反 蟹等 也应作为服药禁忌的参考。